Dokumen SOP FK Undiksha terdiri 74 SOP yaitu : (1) Dua Puluh Dua SOP Pendidikan (2) Empat SOP Penelitian dan Pengabdian Kepada Masyarakat (3) Empat SOP Visi dan Misi (4) Sepuluh SOP Tata Kelola (5) Tiga SOP Kerjasama (6) Enam Belas SOP Kemahasiswaan (7) Enam SOP Sarana dan Prasarana (8) Lima SOP Keuangan (9) Empat SOP Sumber Daya Manusia dan (10) tambahan Sembilan Belas SOP dari Univeristas Pendidikan Ganesha.
Sesuai dengan fundamental dari SPMI adalah perbaikan/pengembangan mutu yang berkelajutan, maka dokumen SOP perlu kiranya dalam kurun waktu tertentu dilakukan peninjauan, perubahan, dan penambahan standar baru sesuai dengan perkembangan kondisi dimasa mendatang. Dengan demikian apa yang sudah ditegaskan FK Undiksha dalam visi dan misi akan tercapai sesuai dengan yang direncanakan.